知道了基因的mRNA,怎样通过mRNA找到它的内含子序列

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/28 16:29:31
知道了基因的mRNA,怎样通过mRNA找到它的内含子序列

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知道了基因的mRNA,怎样通过mRNA找到它的内含子序列
去哪里找最出色的生命科学学术交流论坛?>>> 要看这个物种是不是已经全基因组测序了……
如果已经有了全基因组测序,就可以把整个mRNA序列拿去gene bank去blast(大概应该是那个rna到dna的,还可以试一下蛋白blastDNA的,有时候这个blast会比较准),然后把两个高同源的部分中间的部分复制粘贴下来就行了,如果需要实际拿到序列就根据两边的外显子(如果短)或者中间的部分序列(如果长)设个引物,用提取的核基因组做模板扩一下就行了.
如果没有,那就只好找一个亲缘关系比较近的、已有全基因组测序结果的物种重复一下上面的blast,然后根据中间的长度估一下扩增的条件,然后用两端的外显子设一下引物去扩增获得产物去测序,从而获得内含子序列(以上为个人所知,不一定为正确答案)